Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 AC092032.1-201ENST00000603090 165 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 USP14-201ENST00000261601 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 USP16-204ENST00000399976 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 ZNF793-208ENST00000588578 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 HRH1-201ENST00000397056 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 IKZF5-201ENST00000368886 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 ANK2-203ENST00000394537 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 KPNA1-201ENST00000344337 6830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 ADGRL3-205ENST00000506746 4935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 TRIM66-202ENST00000402157 10086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 NUMB-223ENST00000556772 5172 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 AC116351.1-201ENST00000399869 3482 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 DTNA-225ENST00000595022 6016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 OR7E96P-201ENST00000530816 976 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 METTL15-204ENST00000407364 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 CRNKL1-202ENST00000377340 4406 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 NR1H4-206ENST00000548884 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 FNDC3A-206ENST00000541916 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 RASA2-201ENST00000286364 5614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 SRPX2-201ENST00000373004 6679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 MRPL22-201ENST00000265229 3035 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 AL450992.1-201ENST00000432386 4109 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 AL133467.3-203ENST00000461160 3574 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 PARP9-202ENST00000462315 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 SPATS2L-227ENST00000619961 6115 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 IGHV2-5-201ENST00000390597 378 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AC008496.2-201ENST00000421252 460 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 TUG1_3.1-201ENST00000616187 237 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 BCAS3-234ENST00000639611 108 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 HEPH-201ENST00000336279 4228 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 MAPK10-329ENST00000641555 2656 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 CALCOCO2-201ENST00000258947 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 SLFN13-209ENST00000533791 4121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 ADAM3A-202ENST00000460383 2528 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 ZNF225-206ENST00000592780 2538 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 SMG1P1-202ENST00000309865 4223 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 TTC33-201ENST00000337702 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD11P31277 AC060780.1-202ENST00000590740 5084 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 267.1 ms