Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GEN1Q17RS7 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.7 ms