Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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