Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SCARF1Q14162 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SCARF1Q14162 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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