Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 AC122713.2-201ENST00000624942 3335 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 VPS36-201ENST00000378060 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 KCNA2-205ENST00000633222 11877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 AC002384.1-203ENST00000602761 3049 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 GRIN2A-202ENST00000396573 14450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 SUB1-201ENST00000265073 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 PPIAP22-201ENST00000358455 498 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 RN7SL861P-201ENST00000473793 285 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 MIR8075-201ENST00000614354 80 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 AC233280.20-201ENST00000637412 416 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 GOLGB1-209ENST00000614479 11115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 NDUFS1-204ENST00000440274 2394 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 FBXO40-201ENST00000338040 5929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 ZMYM2-202ENST00000382871 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 RUNX1T1-249ENST00000613886 7401 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 CACNB2-201ENST00000282343 3524 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 ZCCHC2-204ENST00000586834 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 APH1B-201ENST00000261879 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 OR6J1-201ENST00000540461 4165 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 ERAP1-202ENST00000443439 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 OR51D1-202ENST00000641817 3561 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 MAPK10-244ENST00000639972 2818 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 AC018880.1-201ENST00000418898 1319 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 OR1D2-202ENST00000641064 4882 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 ZNF415-214ENST00000597748 2461 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 ELF4-202ENST00000335997 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 DLG1-202ENST00000357674 4931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 ZNF512-208ENST00000556601 3543 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 CEP95-201ENST00000553412 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 RGS8-203ENST00000367557 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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HOXD11P31277 LINC02449-202ENST00000399866 517 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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HOXD11P31277 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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HOXD11P31277 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 ZNF385B-202ENST00000409343 2750 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 PRDM2-203ENST00000343137 5797 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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HOXD11P31277 ATAD2-205ENST00000521903 5143 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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HOXD11P31277 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 FGF9-201ENST00000382353 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 AC010894.3-201ENST00000442996 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 LINC01291-201ENST00000377469 3662 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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HOXD11P31277 GCNT1-202ENST00000442371 5972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 TLN2-209ENST00000561311 11880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 SMG7-202ENST00000367537 5970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 TAT-201ENST00000355962 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 AC066616.1-201ENST00000486795 413 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 RNA5SP287-201ENST00000516358 103 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 ARHGAP42P4-201ENST00000549782 2934 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD11P31277 PECAM1-203ENST00000563924 6831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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