Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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CAPN6Q9Y6Q1 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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CAPN6Q9Y6Q1 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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CAPN6Q9Y6Q1 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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CAPN6Q9Y6Q1 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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CAPN6Q9Y6Q1 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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CAPN6Q9Y6Q1 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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CAPN6Q9Y6Q1 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CAPN6Q9Y6Q1 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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