Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms