Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CCDC85BQ15834 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
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