Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CUL1Q13616 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164 ms