Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHAF1BQ13112 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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