Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
MCCD1P59942 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MCCD1P59942 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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