Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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