Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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TAF1CQ15572 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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TAF1CQ15572 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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TAF1CQ15572 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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TAF1CQ15572 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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TAF1CQ15572 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TAF1CQ15572 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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