Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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NCOA4Q13772 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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NCOA4Q13772 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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NCOA4Q13772 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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NCOA4Q13772 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NCOA4Q13772 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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