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| NAE1 | Q13564 | AL589684.1-201 | ENST00000445974 | 507 nt | TSL 3 BASIC | 3.63 | □□□□□ -1.83 | | |
| NAE1 | Q13564 | PDSS1P2-201 | ENST00000449397 | 678 nt | BASIC | 3.63 | □□□□□ -1.83 | | |
| NAE1 | Q13564 | MTND1P9-201 | ENST00000453775 | 944 nt | BASIC | 3.63 | □□□□□ -1.83 | | |
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| NAE1 | Q13564 | AL353748.2-201 | ENST00000622148 | 471 nt | BASIC | 3.63 | □□□□□ -1.83 | | |
| NAE1 | Q13564 | SPAM1-202 | ENST00000340011 | 2349 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
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| NAE1 | Q13564 | TDRD1-202 | ENST00000369280 | 4062 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
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| NAE1 | Q13564 | MCF2-203 | ENST00000370576 | 3688 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
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| NAE1 | Q13564 | RN7SKP280-201 | ENST00000364196 | 304 nt | BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.359-201 | ENST00000365498 | 102 nt | BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
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| NAE1 | Q13564 | RNU6-297P-201 | ENST00000384636 | 107 nt | BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR135A2-201 | ENST00000384854 | 100 nt | BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
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| NAE1 | Q13564 | AC104777.3-201 | ENST00000416350 | 545 nt | TSL 3 BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
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| NAE1 | Q13564 | LINC00491-204 | ENST00000513815 | 582 nt | TSL 4 BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC099805.1-203 | ENST00000518177 | 773 nt | TSL 2 BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| NAE1 | Q13564 | LINC02365-202 | ENST00000520280 | 607 nt | TSL 3 BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL354920.1-202 | ENST00000531661 | 1017 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL136146.2-201 | ENST00000534594 | 494 nt | TSL 2 BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| NAE1 | Q13564 | PPFIA2-AS1-205 | ENST00000550938 | 790 nt | TSL 3 BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| NAE1 | Q13564 | IGKV2OR2-8-201 | ENST00000558710 | 300 nt | BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC016987.2-201 | ENST00000560696 | 351 nt | TSL 3 BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC138625.1-201 | ENST00000567556 | 483 nt | TSL 3 BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| NAE1 | Q13564 | TMEM87A-212 | ENST00000568432 | 750 nt | TSL 3 BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| NAE1 | Q13564 | AP005120.1-201 | ENST00000579321 | 352 nt | TSL 3 BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC002546.2-201 | ENST00000585537 | 584 nt | TSL 3 BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC009977.1-201 | ENST00000586015 | 570 nt | BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL359999.1-201 | ENST00000604513 | 294 nt | BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC009159.1-201 | ENST00000618386 | 642 nt | BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| NAE1 | Q13564 | CNGA1-201 | ENST00000358519 | 2627 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| NAE1 | Q13564 | LATS1-201 | ENST00000253339 | 4256 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| NAE1 | Q13564 | MBNL1-218 | ENST00000485910 | 4257 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| NAE1 | Q13564 | ATL2-202 | ENST00000402054 | 1883 nt | TSL 5 BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| NAE1 | Q13564 | SEPT7-205 | ENST00000432293 | 1362 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| NAE1 | Q13564 | RTN4-208 | ENST00000404909 | 4102 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.61 | □□□□□ -1.83 | | |
| NAE1 | Q13564 | C1orf141-202 | ENST00000371006 | 2053 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 3.61 | □□□□□ -1.83 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC004160.1-212 | ENST00000421121 | 2078 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.61 | □□□□□ -1.83 | | |
| NAE1 | Q13564 | SYT14-204 | ENST00000472886 | 2966 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.61 | □□□□□ -1.83 | | |
| NAE1 | Q13564 | USP33-201 | ENST00000357428 | 4155 nt | TSL 5 BASIC | 3.61 | □□□□□ -1.83 | | |
| NAE1 | Q13564 | XRN1-202 | ENST00000392981 | 5383 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 3.61 | □□□□□ -1.83 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-1078P-201 | ENST00000364522 | 103 nt | BASIC | 3.61 | □□□□□ -1.83 | | |
| NAE1 | Q13564 | SNORD6-201 | ENST00000365444 | 73 nt | BASIC | 3.61 | □□□□□ -1.83 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-1119P-201 | ENST00000384349 | 108 nt | BASIC | 3.61 | □□□□□ -1.83 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.559-201 | ENST00000384686 | 107 nt | BASIC | 3.61 | □□□□□ -1.83 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC004870.3-202 | ENST00000412996 | 432 nt | TSL 3 BASIC | 3.61 | □□□□□ -1.83 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL138826.1-202 | ENST00000415106 | 692 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.61 | □□□□□ -1.83 | | |