Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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NAE1Q13564 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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NAE1Q13564 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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NAE1Q13564 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
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NAE1Q13564 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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NAE1Q13564 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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NAE1Q13564 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NAE1Q13564 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
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