Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms