Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ALCAMQ13740 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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