Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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ITGB3BPQ13352 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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ITGB3BPQ13352 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ITGB3BPQ13352 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
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