Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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