Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
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TRAF3Q13114 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
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TRAF3Q13114 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
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TRAF3Q13114 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
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