Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q6

TNFRSF11A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF11AQ9Y6Q6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF11AQ9Y6Q6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF11AQ9Y6Q6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNFRSF11AQ9Y6Q6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms