Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLF12Q9Y4X4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms