Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED5Q9Y3A6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED5Q9Y3A6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED5Q9Y3A6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED5Q9Y3A6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED5Q9Y3A6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED5Q9Y3A6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED5Q9Y3A6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED5Q9Y3A6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED5Q9Y3A6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED5Q9Y3A6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED5Q9Y3A6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED5Q9Y3A6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED5Q9Y3A6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED5Q9Y3A6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED5Q9Y3A6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED5Q9Y3A6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED5Q9Y3A6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED5Q9Y3A6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED5Q9Y3A6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED5Q9Y3A6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED5Q9Y3A6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED5Q9Y3A6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED5Q9Y3A6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED5Q9Y3A6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED5Q9Y3A6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED5Q9Y3A6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED5Q9Y3A6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED5Q9Y3A6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED5Q9Y3A6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED5Q9Y3A6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED5Q9Y3A6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED5Q9Y3A6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED5Q9Y3A6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED5Q9Y3A6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMED5Q9Y3A6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMED5Q9Y3A6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms