Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LEMD3Q9Y2U8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms