Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y240

CLEC11A, C-type lectin domain family 11 member A, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC11AQ9Y240 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms