Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF2Q9UNY4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms