Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNRF3Q9ULT6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNRF3Q9ULT6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms