Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PADI1Q9ULC6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms