Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NRXN1Q9ULB1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms