Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PNMA2Q9UL42 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA2Q9UL42 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms