Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms