Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRP68Q9UHB9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRP68Q9UHB9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms