Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CFDP1Q9UEE9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms