Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFIP11Q9UBB9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms