Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRBP1Q9P2E9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRBP1Q9P2E9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms