Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC39.18■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC39.15■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC39.15■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC39.12■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC39.11■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC39.11■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.1■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC39.1■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
CCDC180Q9P1Z9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms