Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPAQ9P0L0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms