Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RBM28Q9NW13 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms