Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC4BQ9NT99 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4BQ9NT99 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms