Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUOX1Q9NRD9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms