Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR64

KLHL1, Kelch-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL1Q9NR64 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL1Q9NR64 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL1Q9NR64 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL1Q9NR64 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL1Q9NR64 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms