Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BATF3Q9NR55 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms