Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARFGAP3Q9NP61 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms