Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS5

EPB41L4A, Band 4.1-like protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L4AQ9HCS5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPB41L4AQ9HCS5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms