Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF41Q9H4P4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF41Q9H4P4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms