Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZW8

MS4A7, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A7Q9GZW8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A7Q9GZW8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A7Q9GZW8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A7Q9GZW8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A7Q9GZW8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MS4A7Q9GZW8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A7Q9GZW8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms