Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRRTQ9BXP5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms