Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRACR2AQ9BSW2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms