Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms