Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN18Q99952 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN18Q99952 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN18Q99952 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN18Q99952 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN18Q99952 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN18Q99952 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN18Q99952 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN18Q99952 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN18Q99952 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN18Q99952 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN18Q99952 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN18Q99952 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN18Q99952 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN18Q99952 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN18Q99952 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN18Q99952 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN18Q99952 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN18Q99952 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN18Q99952 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN18Q99952 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN18Q99952 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN18Q99952 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN18Q99952 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN18Q99952 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN18Q99952 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN18Q99952 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN18Q99952 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN18Q99952 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN18Q99952 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN18Q99952 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN18Q99952 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN18Q99952 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN18Q99952 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN18Q99952 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN18Q99952 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN18Q99952 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms